מחסום דם-מוח מפריד בין מחזור הדם לבין הנוזל המוחי-שידרתי המזין את המוח וחוט השדרה ומגן עליהם. המחסום מורכב מתאים צפופים במיוחד סביב כלי הדם במוח, המאפשרים מעבר סלקטיבי מאוד של מולקולות וחומרים חיוניים אל הנוזל המוחי, ומונע מעבר של חלקיקים גדולים יותר, דוגמת חיידקים.
חשוב: בלוטות ומבנים שונים במוח (יותרת, המוח, היפותלמוס, אצטרובל ואחרים) אינם מוגנים מאחורי מחסום דם-מוח, דבר המאפשר הגעה של חיידקים דרך הדם לפי הצורך (לדוגמה בשלב התיקון, חיידקים אלו מפרקים גידולים בחלק מהבלוטות הללו)